Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms