Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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PHF3Q92576 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PHF3Q92576 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PHF3Q92576 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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