Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD1Q8NHV4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms