Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms