Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHOD3Q2V2M9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms