Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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CTF1Q16619 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTF1Q16619 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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