Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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