Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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