Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM53BQ14153 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms