Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTCH1Q13635 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTCH1Q13635 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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