Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PPP1R1AQ13522 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms