Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms