Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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