Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms