Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms