Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCCD1P59942 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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