Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSE1LP55060 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms