Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms