Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFRP42898 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MTHFRP42898 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MTHFRP42898 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MTHFRP42898 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MTHFRP42898 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MTHFRP42898 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MTHFRP42898 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MTHFRP42898 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MTHFRP42898 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MTHFRP42898 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFRP42898 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFRP42898 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFRP42898 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFRP42898 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms