Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBX2P40425 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBX2P40425 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PBX2P40425 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms