Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA5P28066 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms