Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF7P17544 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF7P17544 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF7P17544 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF7P17544 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF7P17544 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms