Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms