Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTPRFP10586 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTPRFP10586 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTPRFP10586 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTPRFP10586 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRFP10586 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRFP10586 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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