Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BP0C0L5 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms