Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf172C9J069 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.8 ms