Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms