Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms