Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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USP35Q9P2H5 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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USP35Q9P2H5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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USP35Q9P2H5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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USP35Q9P2H5 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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USP35Q9P2H5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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USP35Q9P2H5 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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USP35Q9P2H5 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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