Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT23Q9C075 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms