Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRP1Q9C000 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms