Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC037459.3-201ENST00000521025 2750 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PTGES3L-201ENST00000409446 1781 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 GCM1-201ENST00000259803 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms