Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN18Q96SJ8 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms