Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGF29Q96ES7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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