Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms