Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms