Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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USP13Q92995 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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USP13Q92995 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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USP13Q92995 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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USP13Q92995 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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USP13Q92995 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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USP13Q92995 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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USP13Q92995 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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USP13Q92995 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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