Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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