Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms