Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms