Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SYCP1Q15431 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SYCP1Q15431 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SYCP1Q15431 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SYCP1Q15431 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SYCP1Q15431 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SYCP1Q15431 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SYCP1Q15431 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SYCP1Q15431 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SYCP1Q15431 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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SYCP1Q15431 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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