Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms