Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNIQ14094 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms