Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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