Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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