Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms