Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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FOXE3Q13461 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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FOXE3Q13461 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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FOXE3Q13461 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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FOXE3Q13461 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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FOXE3Q13461 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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FOXE3Q13461 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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FOXE3Q13461 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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