Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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ITGB3BPQ13352 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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