Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRP1Q07954 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms