Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms